Urmand o serie de revolte in Irlanda- care au aparut ca replica la diferentele religioase si la politica coroanei engleze de a introduce noi locuitori din Britania, rezistenta celtilor a fost redusa si in 1603, ultimul bastion celtic, Ulster a fost adus sub controlul Coroanei. Procesul de populare ce a urmat in Ulster a adus multi locuitori englezi si scotieni in Ulster si a avut un impact de lunga durata asupra aspectelor politice si religioase din provincie.
Istoria politica a Irlandei din secolul al-XVII-lea a fost strans legata de evenimentele din Anglia si Scotia, incluzand Razboiul Civil, ascensiunea lui Oliver Cromwel, revenirea lui Charles II de Red Hugh O’ Neill si Revolutia Glorioasa din 1688 care i-a plasat pe William si Mary pe tronul englez. Lupta pentru suprematie dintre englezii catolici si irlandezii celti pe de o parte si noii englezi protestanti (care includeau si mai multi locuitori) pe de alta parte a fost dupa numeroase schimbari de-a lungul perioadei, stabilita intr-un final de catre batalia de la Boyne ( 1690) si Aughrim ( 1691). Vechii englezi si celtii irlandezi au fost distrusi si multi dintre liderii si partizanii lor ( “ The Wild Geese") au parasit Irlanda pentru a urma cariere militare, religioase si comerciale in afara Irlandei. Biserica Protestanta a preluat monopolul puterii politice si asupra pamanturilor, iar prin legile penale ii discriminau pe catolici.