Ninja erau asasini in Japonia medievala. Originea luptatorilor ninja se poate gasi in spionajul aparut cu peste 2500 de ani inainte de Sun Tzu (cca. 400-320 i.e.n.), care afirma, in tratatul sau intitulat “Arta razboiului", ca “nu exista domeniu in care spionii sa nu poata fi folositi cu succes". In pofida anonimatului lor, anumite familii ninja au devenit celebre, la sfarsitul secolului al XVI-lea, cand au intrat in serviciul marilor seniori (daimyo), care ii foloseau in disputele lor cu alte clanuri de samurai. Cea mai mare parte a luptatorilor ninja proveneau din provinciile Iga si Koga (la est de Lacul Biwa). Cu toate acestea, Oda Nobunaga - unul dintre cei trei unificatori ai Japoniei medievale, a incercat sa elimine influenta acestora, iar in anul 1581, 46.000 de samurai au fost trimisi impotriva a 4.000 de ninja. Cea mai mare parte dintre ninja au fost omorati, iar cei care au scapat s-au refugiat in zone retrase din munti, unde s-au amestecat cu satenii.
Ninpo Budo (Ninjitsu), sau arta martiala transmisa de clanurile ninja, este o forma neconventionala de arte martiale, adaptata la o lupta inegala sau la situatii ce il pun pe luptator intr-o pozitie de inferioritate. Sensei Toshitsugu Takamatsu a fost unul dintre ultimii ninja autentici ai perioadei moderne a Japoniei. In prezent, invatatura sa o duce mai departe cel mai avansat elev al sau, Sensei Hatsumi Masaaki, care a reunit toate traditiile ninja sub denumirea de Bujinkan Ninpo Budo. Acesta a primit Premiul International pentru Cultura din partea guvernului japonez, fiind de asemenea detinatorul a nenumarate distinctii onorifice, dintre care amintim: Cavaler al Germaniei si Texas Ranger.
Ninja mai pot fi gasiti si sub denumirea de Shudon